中新社長沙9月15日電 (記者 劉柱)中國農(nóng)業(yè)科學院、阿里云計算有限公司、華智水稻生物技術有限公司、北京聚道科技有限公司15日在長沙共同宣布啟動“云之稻”項目平臺——3000份綠色超級稻基因組原始測序數(shù)據(jù)(下稱“3000份水稻基因組”)。
上述合作者稱,根據(jù)協(xié)議,“云之稻”項目平臺將無償向全球共享數(shù)據(jù),并將逐步建立最全面的“水稻功能基因組和育種信息數(shù)據(jù)庫”,其研究將加快規(guī)模化發(fā)掘水稻優(yōu)良基因,突破水稻復雜性狀分子改良的技術瓶頸,加快高產(chǎn)、優(yōu)質、廣適性新品種培育進程,全面提升中國及全球水稻基因組研究和分子育種水平。
“3000份水稻基因組”是源于國家科技部和比爾·梅琳達蓋茨基金會資助的“為非洲和亞洲資源貧瘠地區(qū)培育綠色超級稻”重大科技專項(簡稱“綠色超級稻”)重要課題成果,是迄今為止全世界最大的植物基因組測序項目。
“3000份水稻基因組”代表了25萬種子中95%的多樣性,其重要性在于分析得到的數(shù)據(jù)將為水稻的基礎認識和育種提供基礎信息資源。
華智水稻生物技術有限公司信息總監(jiān)王冰冰透露,目前,“3000份水稻基因組”分析得到的數(shù)據(jù)量達到幾百TB(萬億字節(jié)),如按常規(guī)方式處理如此大規(guī)模的數(shù)據(jù),單個研究團隊、科研機構均會遇到下載難、存儲難、分析難、運算難等問題,費時費力且成本高。
阿里云高級專家林河山介紹,“云之稻”項目平臺是構建在阿里云的對象存儲服務和批量計算服務之上,在解決上述難題的同時,“‘云之稻’項目平臺上的云端基因組數(shù)據(jù)還可以隨時為全球科學家所用”。
“‘云之稻’項目平臺是公益性的,不僅讓研究者免費下載訪問水稻基因組數(shù)據(jù),還提供常用分析工具和數(shù)據(jù)。”王冰冰說,通過使用這些工具可以免費調用阿里云的計算資源,從而方便快捷地對基因大數(shù)據(jù)進行分析。
綠色超級稻項目首席科學家、中國農(nóng)業(yè)科學院作物科學研究所黎志康博士表示,“3000份水稻基因組”的測序需要全世界所有科學家和有興趣的人士通過“云之稻”項目平臺參與數(shù)據(jù)分析和共享,為加速未來的“水稻設計育種”提供基礎信息資源,“‘云之稻’項目還將結合功能基因組學新的方法和策略進行生物育種,將貢獻于糧食安全、食品健康的發(fā)展”。(完)
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